来完成你的生信作业,这是最有诚意的GEO数据库教程

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来完成你的生信作业,这是最有诚意的GEO数据库教程 by 果子学生信 上次更新了一个GEO数据框的帖子,包含了GEO分析的主要组成部分,其中有些区域为了代码复用,不是很容易懂。现在对其进行注释,并增加KEGG分析的内容,力求能让他变成最有诚意的GEO数据分析教程,文末还录制了一个友好的导学视频,希望物尽其用。

文献分享--食管癌发生的单细胞多阶段空间演化图谱(Xenium)

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文献分享–食管癌发生的单细胞多阶段空间演化图谱(Xenium) by 单细胞空间交响乐 作者,Evil Genius科研之路,并不平坦,唯有坚持,才有胜算。今日参考文献知识积累癌症的发展涉及癌细胞及其周围微环境的共同进化。基因组学和单细胞转录组学的最新进展揭示了肿瘤细胞中突变(TP53、NOTCH1等)的关键作用以及上皮细胞和基质细胞群体之间在驱动癌发展和进展中的复杂相互作用。高分辨率的空间转录组学分析来系统地绘制出癌变过程中细胞状态的空间动态(Xenium)。结果1、多阶段空间转录组学分析揭示ESCC发展中的细胞排布对来自43名代表ESCC发展多个阶段的患者的总共127个FOV进行了空间转录组学分析,其中包括45名正常食管上皮(NOR),25名LGIN,21名HGIN和36名ESCC FOV。300基因探针的Xenium空间技术。结果2、增殖性和侵袭性上皮细胞亚群的扩张驱动ESCC的发展为了描绘上皮细胞在肿瘤发生过程中的演变,分析了ESCC发展多个阶段的4个主要亚群,共1923352个上皮细胞,每个上皮细胞亚群表现出不同的表达谱,并使用来自多阶段样品的scRNAseq数据进一步验证。分析发现,在NOR期,复层鳞状上皮是完整的,具有连续的基底膜,并且三个上皮细胞亚群位于其上方。在NOR期,上皮层再生所必需的基底细胞和增殖细胞主要位于上皮-间质界面附近,分别占上皮厚度的6.

马斯克暴力裁员惹众怒:美国U型锁砸向特斯拉

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马斯克暴力裁员惹众怒:美国U型锁砸向特斯拉 by cnbeta 美国路易斯安那州新奥尔良,上周正是每年一度的狂欢节(Mardi Gras)。在最著名的狂欢节奥菲斯花车游行中,数万名观礼群众站在道路的两边,用掌声和欢呼迎接一辆又一辆的盛装花车。

特斯拉美国车主被疯狂骚扰:车辆被塞小纸片 赶紧卖车

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特斯拉美国车主被疯狂骚扰:车辆被塞小纸片 赶紧卖车 by cnbeta 据报道,马斯克自今年从政以来,因为一些政策的推行和言论,美国和欧洲多地出现了“反马斯克”示威活动。而美国的特斯拉车主,也被迫牵扯其中,不断受到威胁和骚扰。有特斯拉车主发帖称,自己的车窗被塞了小纸片,其上印有马斯克的照片以及“SELL YOUR CAR(卖掉你的车)”的字样。

推荐这本书

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推荐这本书 by 不跪的世界 刚把昨天的读后感文章做成了视频,准备挂YouTube,不打算试Bilibili。